Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer2J3QPU5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer2J3QPU5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms