Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21900J3QP38 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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