Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top6blJ3QMY9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Top6blJ3QMY9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Top6blJ3QMY9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Top6blJ3QMY9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Top6blJ3QMY9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Top6blJ3QMY9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Top6blJ3QMY9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Top6blJ3QMY9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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