Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms