Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Bbip1J3QMK2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms