Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
4930544D05RikJ3QK56 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms