Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20828J3KMI7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.3 ms