Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm340F6RGI3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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