Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms