Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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