Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tgfbr3lD3YZZ2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms