Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1bp1B2KF50 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms