Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
CK137956B1AYM9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CK137956B1AYM9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms