Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Scn7aB1AYL1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn7aB1AYL1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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