Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Trabd2bB1ATG9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trabd2bB1ATG9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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