Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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