Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ttll11A4Q9F4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms