Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Atp8b5A3FIN4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms