Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Scn3aA2ASI5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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