Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Pramef6A2A8M8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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