Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprfA2A8L5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms