Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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CcniQ9Z2V9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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CcniQ9Z2V9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms