Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mbd3Q9Z2D8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms