Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lgr5Q9Z1P4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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