Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn10Q9Z0S6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn10Q9Z0S6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms