Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Apobec2Q9WV35 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Apobec2Q9WV35 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms