Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PrkraQ9WTX2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms