Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sema6cQ9WTM3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms