Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trpc2Q9R244 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Trpc2Q9R244 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms