Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zeb2Q9R0G7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zeb2Q9R0G7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms