Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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