Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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