Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms