Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PolkQ9QUG2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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