Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms