Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms