Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gfra4Q9JJT2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gfra4Q9JJT2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms