Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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