Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Irx6Q9ER75 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irx6Q9ER75 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms