Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms