Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Syde1Q9DBZ9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Syde1Q9DBZ9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms