Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmd12Q9D8W5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms