Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Alkbh4Q9D8F1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms