Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B4

Ndufa11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa11Q9D8B4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa11Q9D8B4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms