Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Chmp5Q9D7S9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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