Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Echdc3Q9D7J9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms