Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms