Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Srp19Q9D7A6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms