Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc9bQ9D6E4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc9bQ9D6E4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc9bQ9D6E4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9bQ9D6E4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9bQ9D6E4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ttc9bQ9D6E4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ttc9bQ9D6E4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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