Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Phf6Q9D4J7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf6Q9D4J7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms